Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc27Q3V036 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc27Q3V036 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc27Q3V036 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.9 ms