Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Skap1Q3UUV5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Skap1Q3UUV5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms