Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc190Q3URK1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc190Q3URK1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc190Q3URK1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms