Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rrp36Q3UFY0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rrp36Q3UFY0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rrp36Q3UFY0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms