Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ctu2Q3U308 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ctu2Q3U308 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ctu2Q3U308 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms