Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf2f1Q3THK3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Gtf2f1Q3THK3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2f1Q3THK3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms