Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col9a2Q07643 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col9a2Q07643 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col9a2Q07643 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col9a2Q07643 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms