Protein–RNA interactions for Protein: Q00609

Cd80, T-lymphocyte activation antigen CD80, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd80Q00609 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd80Q00609 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd80Q00609 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cd80Q00609 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1275.5 ms