Protein–RNA interactions for Protein: P70436

Dlx4, Homeobox protein DLX-4, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dlx4P70436 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dlx4P70436 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dlx4P70436 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms