Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc8a1P70414 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc8a1P70414 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc8a1P70414 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc8a1P70414 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc8a1P70414 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc8a1P70414 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc8a1P70414 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc8a1P70414 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc8a1P70414 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc8a1P70414 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc8a1P70414 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc8a1P70414 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc8a1P70414 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc8a1P70414 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc8a1P70414 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc8a1P70414 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms