Protein–RNA interactions for Protein: P62754

Rps6, 40S ribosomal protein S6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6P62754 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rps6P62754 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rps6P62754 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rps6P62754 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rps6P62754 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rps6P62754 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rps6P62754 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6P62754 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6P62754 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6P62754 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6P62754 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6P62754 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6P62754 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6P62754 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps6P62754 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rps6P62754 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6P62754 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6P62754 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rps6P62754 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6P62754 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6P62754 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6P62754 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6P62754 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6P62754 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6P62754 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rps6P62754 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rps6P62754 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rps6P62754 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms