Protein–RNA interactions for Protein: P60867

Rps20, 40S ribosomal protein S20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps20P60867 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rps20P60867 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps20P60867 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps20P60867 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rps20P60867 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps20P60867 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rps20P60867 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms