Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtnsP57757 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtnsP57757 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CtnsP57757 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CtnsP57757 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtnsP57757 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtnsP57757 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtnsP57757 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CtnsP57757 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtnsP57757 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CtnsP57757 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtnsP57757 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CtnsP57757 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms