Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp5P56399 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp5P56399 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp5P56399 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp5P56399 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp5P56399 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp5P56399 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp5P56399 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp5P56399 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp5P56399 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp5P56399 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp5P56399 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Usp5P56399 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms