Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccr1P51675 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccr1P51675 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ccr1P51675 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms