Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa11P50709 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa11P50709 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms