Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa11P50709 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa11P50709 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Defa11P50709 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.7 ms