Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Rpl28P41105 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms