Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gria1P23818 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria1P23818 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria1P23818 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gria1P23818 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gria1P23818 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria1P23818 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gria1P23818 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gria1P23818 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria1P23818 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria1P23818 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gria1P23818 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms