Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tcn2O88968 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tcn2O88968 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms