Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sema3fO88632 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sema3fO88632 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sema3fO88632 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms