Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2f6O54917 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2f6O54917 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
E2f6O54917 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2f6O54917 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2f6O54917 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2f6O54917 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2f6O54917 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2f6O54917 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
E2f6O54917 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2f6O54917 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
E2f6O54917 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
E2f6O54917 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 347.8 ms