Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f3O35261 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f3O35261 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
E2f3O35261 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f3O35261 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
E2f3O35261 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f3O35261 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f3O35261 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f3O35261 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f3O35261 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
E2f3O35261 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms