Protein–RNA interactions for Protein: J3QNN2

Gm21976, Predicted gene 21976, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21976J3QNN2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm21976J3QNN2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm21976J3QNN2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm21976J3QNN2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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