Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34aG3UW52 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34aG3UW52 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34aG3UW52 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34aG3UW52 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cldn34aG3UW52 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cldn34aG3UW52 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cldn34aG3UW52 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms