Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
2610001J05RikF2Z3Y9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
2610001J05RikF2Z3Y9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms