Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TrdnE9Q9K5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrdnE9Q9K5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrdnE9Q9K5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms