Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r68E9Q0V3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vmn1r68E9Q0V3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r68E9Q0V3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms