Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm20425E9Q035 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm20425E9Q035 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm20425E9Q035 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm20425E9Q035 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm20425E9Q035 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm20425E9Q035 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gm20425E9Q035 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm20425E9Q035 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm20425E9Q035 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm20425E9Q035 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm20425E9Q035 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm20425E9Q035 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm20425E9Q035 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20425E9Q035 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20425E9Q035 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms