Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vpreb3D3Z6J4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vpreb3D3Z6J4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.1 ms