Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ptrhd1D3Z4S3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ptrhd1D3Z4S3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms