Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
3425401B19RikD3Z1D3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.68
3425401B19RikD3Z1D3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms