Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Kif28pD3YXS5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kif28pD3YXS5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kif28pD3YXS5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms