Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nipsnap3aB1AWZ3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms