Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D0

Mtmr9, Myotubularin-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr9Q9Z2D0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Mtmr9Q9Z2D0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Mtmr9Q9Z2D0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Mtmr9Q9Z2D0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Mtmr9Q9Z2D0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Mtmr9Q9Z2D0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Mtmr9Q9Z2D0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Mtmr9Q9Z2D0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Mtmr9Q9Z2D0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Mtmr9Q9Z2D0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Mtmr9Q9Z2D0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Mtmr9Q9Z2D0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Mtmr9Q9Z2D0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Mtmr9Q9Z2D0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Mtmr9Q9Z2D0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Mtmr9Q9Z2D0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Mtmr9Q9Z2D0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Mtmr9Q9Z2D0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Mtmr9Q9Z2D0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Mtmr9Q9Z2D0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Mtmr9Q9Z2D0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Mtmr9Q9Z2D0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Mtmr9Q9Z2D0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Mtmr9Q9Z2D0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Mtmr9Q9Z2D0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Mtmr9Q9Z2D0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Mtmr9Q9Z2D0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Mtmr9Q9Z2D0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Mtmr9Q9Z2D0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Mtmr9Q9Z2D0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Mtmr9Q9Z2D0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Mtmr9Q9Z2D0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Mtmr9Q9Z2D0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Mtmr9Q9Z2D0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Mtmr9Q9Z2D0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Mtmr9Q9Z2D0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Mtmr9Q9Z2D0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Mtmr9Q9Z2D0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Mtmr9Q9Z2D0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Mtmr9Q9Z2D0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
Mtmr9Q9Z2D0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Mtmr9Q9Z2D0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Mtmr9Q9Z2D0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Mtmr9Q9Z2D0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Mtmr9Q9Z2D0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Mtmr9Q9Z2D0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Mtmr9Q9Z2D0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Mtmr9Q9Z2D0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Mtmr9Q9Z2D0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Mtmr9Q9Z2D0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Mtmr9Q9Z2D0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Mtmr9Q9Z2D0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Mtmr9Q9Z2D0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Mtmr9Q9Z2D0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Mtmr9Q9Z2D0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Mtmr9Q9Z2D0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Mtmr9Q9Z2D0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Mtmr9Q9Z2D0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Mtmr9Q9Z2D0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Mtmr9Q9Z2D0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Mtmr9Q9Z2D0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Mtmr9Q9Z2D0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Mtmr9Q9Z2D0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Mtmr9Q9Z2D0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Mtmr9Q9Z2D0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Mtmr9Q9Z2D0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Mtmr9Q9Z2D0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Mtmr9Q9Z2D0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Mtmr9Q9Z2D0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Mtmr9Q9Z2D0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Mtmr9Q9Z2D0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Mtmr9Q9Z2D0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Mtmr9Q9Z2D0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Mtmr9Q9Z2D0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Mtmr9Q9Z2D0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Mtmr9Q9Z2D0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Mtmr9Q9Z2D0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Mtmr9Q9Z2D0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Mtmr9Q9Z2D0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Mtmr9Q9Z2D0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Mtmr9Q9Z2D0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Mtmr9Q9Z2D0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Mtmr9Q9Z2D0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Mtmr9Q9Z2D0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Mtmr9Q9Z2D0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Mtmr9Q9Z2D0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Mtmr9Q9Z2D0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Mtmr9Q9Z2D0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Mtmr9Q9Z2D0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Mtmr9Q9Z2D0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Mtmr9Q9Z2D0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Mtmr9Q9Z2D0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Mtmr9Q9Z2D0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Mtmr9Q9Z2D0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Mtmr9Q9Z2D0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Mtmr9Q9Z2D0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Mtmr9Q9Z2D0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Mtmr9Q9Z2D0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Mtmr9Q9Z2D0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mtmr9Q9Z2D0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms