Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX6

Cul1, Cullin-1, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul1Q9WTX6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cul1Q9WTX6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cul1Q9WTX6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cul1Q9WTX6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cul1Q9WTX6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul1Q9WTX6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cul1Q9WTX6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cul1Q9WTX6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cul1Q9WTX6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cul1Q9WTX6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cul1Q9WTX6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cul1Q9WTX6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cul1Q9WTX6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cul1Q9WTX6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cul1Q9WTX6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Cul1Q9WTX6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cul1Q9WTX6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cul1Q9WTX6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cul1Q9WTX6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cul1Q9WTX6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cul1Q9WTX6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Cul1Q9WTX6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cul1Q9WTX6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cul1Q9WTX6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cul1Q9WTX6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cul1Q9WTX6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cul1Q9WTX6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul1Q9WTX6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul1Q9WTX6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul1Q9WTX6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cul1Q9WTX6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Cul1Q9WTX6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cul1Q9WTX6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Cul1Q9WTX6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cul1Q9WTX6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul1Q9WTX6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cul1Q9WTX6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cul1Q9WTX6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cul1Q9WTX6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cul1Q9WTX6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul1Q9WTX6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cul1Q9WTX6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cul1Q9WTX6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cul1Q9WTX6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cul1Q9WTX6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul1Q9WTX6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cul1Q9WTX6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cul1Q9WTX6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cul1Q9WTX6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cul1Q9WTX6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cul1Q9WTX6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cul1Q9WTX6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cul1Q9WTX6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cul1Q9WTX6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul1Q9WTX6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul1Q9WTX6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cul1Q9WTX6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul1Q9WTX6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cul1Q9WTX6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cul1Q9WTX6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cul1Q9WTX6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cul1Q9WTX6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cul1Q9WTX6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul1Q9WTX6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul1Q9WTX6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cul1Q9WTX6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul1Q9WTX6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cul1Q9WTX6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul1Q9WTX6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cul1Q9WTX6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cul1Q9WTX6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cul1Q9WTX6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul1Q9WTX6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cul1Q9WTX6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cul1Q9WTX6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul1Q9WTX6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cul1Q9WTX6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cul1Q9WTX6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cul1Q9WTX6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cul1Q9WTX6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cul1Q9WTX6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cul1Q9WTX6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul1Q9WTX6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cul1Q9WTX6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cul1Q9WTX6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul1Q9WTX6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul1Q9WTX6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cul1Q9WTX6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cul1Q9WTX6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Cul1Q9WTX6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cul1Q9WTX6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul1Q9WTX6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul1Q9WTX6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cul1Q9WTX6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cul1Q9WTX6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cul1Q9WTX6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cul1Q9WTX6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cul1Q9WTX6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cul1Q9WTX6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Cul1Q9WTX6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms