Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ubxn8Q9QZ49 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Ubxn8Q9QZ49 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ubxn8Q9QZ49 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Ubxn8Q9QZ49 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Ubxn8Q9QZ49 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Ubxn8Q9QZ49 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ubxn8Q9QZ49 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Ubxn8Q9QZ49 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Ubxn8Q9QZ49 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Ubxn8Q9QZ49 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Ubxn8Q9QZ49 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ubxn8Q9QZ49 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ubxn8Q9QZ49 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Ubxn8Q9QZ49 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ubxn8Q9QZ49 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ubxn8Q9QZ49 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ubxn8Q9QZ49 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Ubxn8Q9QZ49 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Ubxn8Q9QZ49 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ubxn8Q9QZ49 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ubxn8Q9QZ49 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ubxn8Q9QZ49 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ubxn8Q9QZ49 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ubxn8Q9QZ49 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ubxn8Q9QZ49 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ubxn8Q9QZ49 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ubxn8Q9QZ49 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ubxn8Q9QZ49 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ubxn8Q9QZ49 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ubxn8Q9QZ49 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ubxn8Q9QZ49 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ubxn8Q9QZ49 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ubxn8Q9QZ49 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ubxn8Q9QZ49 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Ubxn8Q9QZ49 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
Ubxn8Q9QZ49 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Ubxn8Q9QZ49 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Ubxn8Q9QZ49 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Ubxn8Q9QZ49 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ubxn8Q9QZ49 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ubxn8Q9QZ49 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ubxn8Q9QZ49 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ubxn8Q9QZ49 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Ubxn8Q9QZ49 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ubxn8Q9QZ49 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ubxn8Q9QZ49 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ubxn8Q9QZ49 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Ubxn8Q9QZ49 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ubxn8Q9QZ49 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ubxn8Q9QZ49 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ubxn8Q9QZ49 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Ubxn8Q9QZ49 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Ubxn8Q9QZ49 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Ubxn8Q9QZ49 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Ubxn8Q9QZ49 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ubxn8Q9QZ49 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ubxn8Q9QZ49 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ubxn8Q9QZ49 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ubxn8Q9QZ49 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ubxn8Q9QZ49 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ubxn8Q9QZ49 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ubxn8Q9QZ49 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ubxn8Q9QZ49 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ubxn8Q9QZ49 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ubxn8Q9QZ49 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ubxn8Q9QZ49 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ubxn8Q9QZ49 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ubxn8Q9QZ49 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ubxn8Q9QZ49 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ubxn8Q9QZ49 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Ubxn8Q9QZ49 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ubxn8Q9QZ49 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ubxn8Q9QZ49 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ubxn8Q9QZ49 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ubxn8Q9QZ49 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ubxn8Q9QZ49 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ubxn8Q9QZ49 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Ubxn8Q9QZ49 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ubxn8Q9QZ49 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ubxn8Q9QZ49 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ubxn8Q9QZ49 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ubxn8Q9QZ49 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ubxn8Q9QZ49 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ubxn8Q9QZ49 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ubxn8Q9QZ49 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ubxn8Q9QZ49 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ubxn8Q9QZ49 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ubxn8Q9QZ49 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ubxn8Q9QZ49 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ubxn8Q9QZ49 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ubxn8Q9QZ49 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ubxn8Q9QZ49 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ubxn8Q9QZ49 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ubxn8Q9QZ49 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubxn8Q9QZ49 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Ubxn8Q9QZ49 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ubxn8Q9QZ49 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms