Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXP7

C1qtnf1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf1Q9QXP7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C1qtnf1Q9QXP7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
C1qtnf1Q9QXP7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C1qtnf1Q9QXP7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C1qtnf1Q9QXP7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C1qtnf1Q9QXP7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
C1qtnf1Q9QXP7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C1qtnf1Q9QXP7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C1qtnf1Q9QXP7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
C1qtnf1Q9QXP7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C1qtnf1Q9QXP7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
C1qtnf1Q9QXP7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C1qtnf1Q9QXP7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C1qtnf1Q9QXP7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C1qtnf1Q9QXP7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
C1qtnf1Q9QXP7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C1qtnf1Q9QXP7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C1qtnf1Q9QXP7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C1qtnf1Q9QXP7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
C1qtnf1Q9QXP7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
C1qtnf1Q9QXP7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C1qtnf1Q9QXP7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
C1qtnf1Q9QXP7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
C1qtnf1Q9QXP7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C1qtnf1Q9QXP7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
C1qtnf1Q9QXP7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
C1qtnf1Q9QXP7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
C1qtnf1Q9QXP7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
C1qtnf1Q9QXP7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
C1qtnf1Q9QXP7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
C1qtnf1Q9QXP7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
C1qtnf1Q9QXP7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
C1qtnf1Q9QXP7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
C1qtnf1Q9QXP7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
C1qtnf1Q9QXP7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
C1qtnf1Q9QXP7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
C1qtnf1Q9QXP7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
C1qtnf1Q9QXP7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C1qtnf1Q9QXP7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C1qtnf1Q9QXP7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C1qtnf1Q9QXP7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C1qtnf1Q9QXP7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
C1qtnf1Q9QXP7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C1qtnf1Q9QXP7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
C1qtnf1Q9QXP7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C1qtnf1Q9QXP7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C1qtnf1Q9QXP7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C1qtnf1Q9QXP7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C1qtnf1Q9QXP7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C1qtnf1Q9QXP7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
C1qtnf1Q9QXP7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C1qtnf1Q9QXP7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C1qtnf1Q9QXP7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C1qtnf1Q9QXP7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C1qtnf1Q9QXP7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C1qtnf1Q9QXP7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C1qtnf1Q9QXP7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C1qtnf1Q9QXP7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
C1qtnf1Q9QXP7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
C1qtnf1Q9QXP7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1qtnf1Q9QXP7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1qtnf1Q9QXP7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
C1qtnf1Q9QXP7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
C1qtnf1Q9QXP7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
C1qtnf1Q9QXP7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
C1qtnf1Q9QXP7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C1qtnf1Q9QXP7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
C1qtnf1Q9QXP7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C1qtnf1Q9QXP7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
C1qtnf1Q9QXP7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
C1qtnf1Q9QXP7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
C1qtnf1Q9QXP7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C1qtnf1Q9QXP7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C1qtnf1Q9QXP7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C1qtnf1Q9QXP7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C1qtnf1Q9QXP7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C1qtnf1Q9QXP7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C1qtnf1Q9QXP7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
C1qtnf1Q9QXP7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C1qtnf1Q9QXP7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
C1qtnf1Q9QXP7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C1qtnf1Q9QXP7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C1qtnf1Q9QXP7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C1qtnf1Q9QXP7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C1qtnf1Q9QXP7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
C1qtnf1Q9QXP7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C1qtnf1Q9QXP7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C1qtnf1Q9QXP7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
C1qtnf1Q9QXP7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C1qtnf1Q9QXP7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C1qtnf1Q9QXP7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
C1qtnf1Q9QXP7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C1qtnf1Q9QXP7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C1qtnf1Q9QXP7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C1qtnf1Q9QXP7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
C1qtnf1Q9QXP7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
C1qtnf1Q9QXP7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C1qtnf1Q9QXP7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C1qtnf1Q9QXP7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C1qtnf1Q9QXP7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms