Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN0

Shroom3, Protein Shroom3, mousemouse

Predictions only

Length 1,986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom3Q9QXN0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Shroom3Q9QXN0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Shroom3Q9QXN0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Shroom3Q9QXN0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Shroom3Q9QXN0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Shroom3Q9QXN0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Shroom3Q9QXN0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Shroom3Q9QXN0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Shroom3Q9QXN0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Shroom3Q9QXN0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom3Q9QXN0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Shroom3Q9QXN0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom3Q9QXN0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom3Q9QXN0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Shroom3Q9QXN0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom3Q9QXN0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Shroom3Q9QXN0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Shroom3Q9QXN0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Shroom3Q9QXN0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Shroom3Q9QXN0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Shroom3Q9QXN0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Shroom3Q9QXN0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Shroom3Q9QXN0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Shroom3Q9QXN0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shroom3Q9QXN0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Shroom3Q9QXN0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shroom3Q9QXN0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Shroom3Q9QXN0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Shroom3Q9QXN0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Shroom3Q9QXN0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Shroom3Q9QXN0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Shroom3Q9QXN0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Shroom3Q9QXN0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shroom3Q9QXN0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Shroom3Q9QXN0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Shroom3Q9QXN0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Shroom3Q9QXN0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Shroom3Q9QXN0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Shroom3Q9QXN0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Shroom3Q9QXN0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Shroom3Q9QXN0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Shroom3Q9QXN0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shroom3Q9QXN0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Shroom3Q9QXN0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Shroom3Q9QXN0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Shroom3Q9QXN0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Shroom3Q9QXN0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Shroom3Q9QXN0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shroom3Q9QXN0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Shroom3Q9QXN0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Shroom3Q9QXN0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Shroom3Q9QXN0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shroom3Q9QXN0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shroom3Q9QXN0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shroom3Q9QXN0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Shroom3Q9QXN0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Shroom3Q9QXN0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Shroom3Q9QXN0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Shroom3Q9QXN0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom3Q9QXN0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Shroom3Q9QXN0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Shroom3Q9QXN0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Shroom3Q9QXN0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Shroom3Q9QXN0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Shroom3Q9QXN0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Shroom3Q9QXN0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Shroom3Q9QXN0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Shroom3Q9QXN0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Shroom3Q9QXN0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Shroom3Q9QXN0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
Shroom3Q9QXN0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Shroom3Q9QXN0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Shroom3Q9QXN0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Shroom3Q9QXN0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Shroom3Q9QXN0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Shroom3Q9QXN0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Shroom3Q9QXN0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Shroom3Q9QXN0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Shroom3Q9QXN0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Shroom3Q9QXN0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shroom3Q9QXN0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Shroom3Q9QXN0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Shroom3Q9QXN0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Shroom3Q9QXN0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Shroom3Q9QXN0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Shroom3Q9QXN0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Shroom3Q9QXN0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Shroom3Q9QXN0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shroom3Q9QXN0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shroom3Q9QXN0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Shroom3Q9QXN0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Shroom3Q9QXN0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Shroom3Q9QXN0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Shroom3Q9QXN0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Shroom3Q9QXN0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Shroom3Q9QXN0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shroom3Q9QXN0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Shroom3Q9QXN0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Shroom3Q9QXN0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Shroom3Q9QXN0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms