Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWV9

Ccnt1, Cyclin-T1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnt1Q9QWV9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ccnt1Q9QWV9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccnt1Q9QWV9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ccnt1Q9QWV9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ccnt1Q9QWV9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ccnt1Q9QWV9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccnt1Q9QWV9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccnt1Q9QWV9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ccnt1Q9QWV9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ccnt1Q9QWV9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ccnt1Q9QWV9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ccnt1Q9QWV9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ccnt1Q9QWV9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ccnt1Q9QWV9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ccnt1Q9QWV9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ccnt1Q9QWV9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Ccnt1Q9QWV9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Ccnt1Q9QWV9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ccnt1Q9QWV9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ccnt1Q9QWV9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ccnt1Q9QWV9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Ccnt1Q9QWV9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ccnt1Q9QWV9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Ccnt1Q9QWV9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Ccnt1Q9QWV9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ccnt1Q9QWV9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ccnt1Q9QWV9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccnt1Q9QWV9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ccnt1Q9QWV9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ccnt1Q9QWV9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccnt1Q9QWV9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ccnt1Q9QWV9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccnt1Q9QWV9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ccnt1Q9QWV9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Ccnt1Q9QWV9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Ccnt1Q9QWV9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Ccnt1Q9QWV9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
Ccnt1Q9QWV9 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Ccnt1Q9QWV9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccnt1Q9QWV9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Ccnt1Q9QWV9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ccnt1Q9QWV9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ccnt1Q9QWV9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ccnt1Q9QWV9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ccnt1Q9QWV9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccnt1Q9QWV9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccnt1Q9QWV9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ccnt1Q9QWV9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Ccnt1Q9QWV9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccnt1Q9QWV9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ccnt1Q9QWV9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccnt1Q9QWV9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ccnt1Q9QWV9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ccnt1Q9QWV9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccnt1Q9QWV9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ccnt1Q9QWV9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ccnt1Q9QWV9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ccnt1Q9QWV9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccnt1Q9QWV9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccnt1Q9QWV9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ccnt1Q9QWV9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ccnt1Q9QWV9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ccnt1Q9QWV9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccnt1Q9QWV9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ccnt1Q9QWV9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ccnt1Q9QWV9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ccnt1Q9QWV9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ccnt1Q9QWV9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ccnt1Q9QWV9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ccnt1Q9QWV9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ccnt1Q9QWV9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ccnt1Q9QWV9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccnt1Q9QWV9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ccnt1Q9QWV9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ccnt1Q9QWV9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ccnt1Q9QWV9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Ccnt1Q9QWV9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Ccnt1Q9QWV9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccnt1Q9QWV9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ccnt1Q9QWV9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ccnt1Q9QWV9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ccnt1Q9QWV9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccnt1Q9QWV9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccnt1Q9QWV9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccnt1Q9QWV9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccnt1Q9QWV9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccnt1Q9QWV9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Ccnt1Q9QWV9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccnt1Q9QWV9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccnt1Q9QWV9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccnt1Q9QWV9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccnt1Q9QWV9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccnt1Q9QWV9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccnt1Q9QWV9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccnt1Q9QWV9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccnt1Q9QWV9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccnt1Q9QWV9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccnt1Q9QWV9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccnt1Q9QWV9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccnt1Q9QWV9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms