Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
Cabp1Q9JLK7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Cabp1Q9JLK7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Cabp1Q9JLK7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC42.13■■■■■ 4.33
Cabp1Q9JLK7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Cabp1Q9JLK7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Cabp1Q9JLK7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Cabp1Q9JLK7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
Cabp1Q9JLK7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Cabp1Q9JLK7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Cabp1Q9JLK7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
Cabp1Q9JLK7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
Cabp1Q9JLK7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
Cabp1Q9JLK7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Cabp1Q9JLK7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Cabp1Q9JLK7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Cabp1Q9JLK7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Cabp1Q9JLK7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
Cabp1Q9JLK7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Cabp1Q9JLK7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Cabp1Q9JLK7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Cabp1Q9JLK7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Cabp1Q9JLK7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Cabp1Q9JLK7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
Cabp1Q9JLK7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Cabp1Q9JLK7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Cabp1Q9JLK7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Cabp1Q9JLK7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
Cabp1Q9JLK7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Cabp1Q9JLK7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC41.2■■■■■ 4.19
Cabp1Q9JLK7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Cabp1Q9JLK7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Cabp1Q9JLK7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
Cabp1Q9JLK7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Cabp1Q9JLK7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Cabp1Q9JLK7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Cabp1Q9JLK7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Cabp1Q9JLK7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Cabp1Q9JLK7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC40.97■■■■■ 4.15
Cabp1Q9JLK7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Cabp1Q9JLK7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
Cabp1Q9JLK7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Cabp1Q9JLK7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
Cabp1Q9JLK7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Cabp1Q9JLK7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Cabp1Q9JLK7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Cabp1Q9JLK7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
Cabp1Q9JLK7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Cabp1Q9JLK7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Cabp1Q9JLK7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Cabp1Q9JLK7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Cabp1Q9JLK7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Cabp1Q9JLK7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
Cabp1Q9JLK7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Cabp1Q9JLK7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Cabp1Q9JLK7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Cabp1Q9JLK7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Cabp1Q9JLK7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Cabp1Q9JLK7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Cabp1Q9JLK7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Cabp1Q9JLK7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Cabp1Q9JLK7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Cabp1Q9JLK7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Cabp1Q9JLK7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Cabp1Q9JLK7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Cabp1Q9JLK7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Cabp1Q9JLK7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
Cabp1Q9JLK7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
Cabp1Q9JLK7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
Cabp1Q9JLK7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
Cabp1Q9JLK7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Cabp1Q9JLK7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Cabp1Q9JLK7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Cabp1Q9JLK7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Cabp1Q9JLK7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
Cabp1Q9JLK7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
Cabp1Q9JLK7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Cabp1Q9JLK7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Cabp1Q9JLK7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Cabp1Q9JLK7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
Cabp1Q9JLK7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3.99
Cabp1Q9JLK7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Cabp1Q9JLK7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Cabp1Q9JLK7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
Cabp1Q9JLK7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Cabp1Q9JLK7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
Cabp1Q9JLK7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Cabp1Q9JLK7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Cabp1Q9JLK7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
Cabp1Q9JLK7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
Cabp1Q9JLK7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Cabp1Q9JLK7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
Cabp1Q9JLK7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
Cabp1Q9JLK7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC39.85■■■■□ 3.97
Cabp1Q9JLK7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
Cabp1Q9JLK7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Cabp1Q9JLK7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Cabp1Q9JLK7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Cabp1Q9JLK7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms