Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Tmod4Q9JLH8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Tmod4Q9JLH8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Tmod4Q9JLH8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tmod4Q9JLH8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Tmod4Q9JLH8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Tmod4Q9JLH8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Tmod4Q9JLH8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Tmod4Q9JLH8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Tmod4Q9JLH8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Tmod4Q9JLH8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tmod4Q9JLH8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Tmod4Q9JLH8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Tmod4Q9JLH8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Tmod4Q9JLH8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Tmod4Q9JLH8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Tmod4Q9JLH8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Tmod4Q9JLH8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Tmod4Q9JLH8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Tmod4Q9JLH8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Tmod4Q9JLH8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Tmod4Q9JLH8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Tmod4Q9JLH8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Tmod4Q9JLH8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tmod4Q9JLH8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Tmod4Q9JLH8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Tmod4Q9JLH8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Tmod4Q9JLH8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Tmod4Q9JLH8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Tmod4Q9JLH8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Tmod4Q9JLH8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Tmod4Q9JLH8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Tmod4Q9JLH8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Tmod4Q9JLH8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Tmod4Q9JLH8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Tmod4Q9JLH8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Tmod4Q9JLH8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Tmod4Q9JLH8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Tmod4Q9JLH8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Tmod4Q9JLH8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Tmod4Q9JLH8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Tmod4Q9JLH8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Tmod4Q9JLH8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Tmod4Q9JLH8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Tmod4Q9JLH8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Tmod4Q9JLH8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Tmod4Q9JLH8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tmod4Q9JLH8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Tmod4Q9JLH8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Tmod4Q9JLH8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Tmod4Q9JLH8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Tmod4Q9JLH8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Tmod4Q9JLH8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
Tmod4Q9JLH8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Tmod4Q9JLH8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Tmod4Q9JLH8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tmod4Q9JLH8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tmod4Q9JLH8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tmod4Q9JLH8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Tmod4Q9JLH8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Tmod4Q9JLH8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Tmod4Q9JLH8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Tmod4Q9JLH8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Tmod4Q9JLH8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tmod4Q9JLH8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tmod4Q9JLH8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Tmod4Q9JLH8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tmod4Q9JLH8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Tmod4Q9JLH8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tmod4Q9JLH8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Tmod4Q9JLH8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tmod4Q9JLH8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tmod4Q9JLH8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tmod4Q9JLH8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Tmod4Q9JLH8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Tmod4Q9JLH8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tmod4Q9JLH8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tmod4Q9JLH8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tmod4Q9JLH8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Tmod4Q9JLH8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tmod4Q9JLH8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Tmod4Q9JLH8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Tmod4Q9JLH8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Tmod4Q9JLH8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tmod4Q9JLH8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tmod4Q9JLH8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tmod4Q9JLH8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Tmod4Q9JLH8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tmod4Q9JLH8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Tmod4Q9JLH8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Tmod4Q9JLH8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tmod4Q9JLH8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tmod4Q9JLH8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Tmod4Q9JLH8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tmod4Q9JLH8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tmod4Q9JLH8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Tmod4Q9JLH8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
Tmod4Q9JLH8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Tmod4Q9JLH8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tmod4Q9JLH8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
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