Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Irx5Q9JKQ4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Irx5Q9JKQ4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Irx5Q9JKQ4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Irx5Q9JKQ4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Irx5Q9JKQ4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Irx5Q9JKQ4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Irx5Q9JKQ4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Irx5Q9JKQ4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Irx5Q9JKQ4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Irx5Q9JKQ4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Irx5Q9JKQ4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Irx5Q9JKQ4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Irx5Q9JKQ4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Irx5Q9JKQ4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Irx5Q9JKQ4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Irx5Q9JKQ4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Irx5Q9JKQ4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Irx5Q9JKQ4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Irx5Q9JKQ4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Irx5Q9JKQ4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Irx5Q9JKQ4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Irx5Q9JKQ4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Irx5Q9JKQ4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Irx5Q9JKQ4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Irx5Q9JKQ4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Irx5Q9JKQ4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Irx5Q9JKQ4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Irx5Q9JKQ4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Irx5Q9JKQ4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Irx5Q9JKQ4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Irx5Q9JKQ4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Irx5Q9JKQ4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Irx5Q9JKQ4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Irx5Q9JKQ4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Irx5Q9JKQ4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Irx5Q9JKQ4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Irx5Q9JKQ4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Irx5Q9JKQ4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Irx5Q9JKQ4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Irx5Q9JKQ4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Irx5Q9JKQ4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Irx5Q9JKQ4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Irx5Q9JKQ4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Irx5Q9JKQ4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Irx5Q9JKQ4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Irx5Q9JKQ4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Irx5Q9JKQ4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Irx5Q9JKQ4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Irx5Q9JKQ4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Irx5Q9JKQ4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Irx5Q9JKQ4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Irx5Q9JKQ4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Irx5Q9JKQ4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Irx5Q9JKQ4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Irx5Q9JKQ4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Irx5Q9JKQ4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Irx5Q9JKQ4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Irx5Q9JKQ4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Irx5Q9JKQ4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Irx5Q9JKQ4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Irx5Q9JKQ4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Irx5Q9JKQ4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Irx5Q9JKQ4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Irx5Q9JKQ4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Irx5Q9JKQ4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Irx5Q9JKQ4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Irx5Q9JKQ4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Irx5Q9JKQ4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Irx5Q9JKQ4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Irx5Q9JKQ4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Irx5Q9JKQ4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Irx5Q9JKQ4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Irx5Q9JKQ4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Irx5Q9JKQ4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Irx5Q9JKQ4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Irx5Q9JKQ4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Irx5Q9JKQ4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Irx5Q9JKQ4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Irx5Q9JKQ4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Irx5Q9JKQ4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Irx5Q9JKQ4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Irx5Q9JKQ4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Irx5Q9JKQ4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Irx5Q9JKQ4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Irx5Q9JKQ4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Irx5Q9JKQ4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Irx5Q9JKQ4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Irx5Q9JKQ4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Irx5Q9JKQ4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Irx5Q9JKQ4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Irx5Q9JKQ4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Irx5Q9JKQ4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Irx5Q9JKQ4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Irx5Q9JKQ4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Irx5Q9JKQ4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms