Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Rcan3Q9JKK0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rcan3Q9JKK0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Rcan3Q9JKK0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Rcan3Q9JKK0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rcan3Q9JKK0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rcan3Q9JKK0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rcan3Q9JKK0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rcan3Q9JKK0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rcan3Q9JKK0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Rcan3Q9JKK0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rcan3Q9JKK0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rcan3Q9JKK0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Rcan3Q9JKK0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rcan3Q9JKK0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rcan3Q9JKK0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rcan3Q9JKK0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rcan3Q9JKK0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rcan3Q9JKK0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Rcan3Q9JKK0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rcan3Q9JKK0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rcan3Q9JKK0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rcan3Q9JKK0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rcan3Q9JKK0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rcan3Q9JKK0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Rcan3Q9JKK0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rcan3Q9JKK0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rcan3Q9JKK0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rcan3Q9JKK0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rcan3Q9JKK0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rcan3Q9JKK0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rcan3Q9JKK0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rcan3Q9JKK0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rcan3Q9JKK0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Rcan3Q9JKK0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Rcan3Q9JKK0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Rcan3Q9JKK0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Rcan3Q9JKK0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rcan3Q9JKK0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rcan3Q9JKK0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rcan3Q9JKK0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Rcan3Q9JKK0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Rcan3Q9JKK0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Rcan3Q9JKK0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rcan3Q9JKK0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Rcan3Q9JKK0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rcan3Q9JKK0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Rcan3Q9JKK0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rcan3Q9JKK0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rcan3Q9JKK0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Rcan3Q9JKK0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Rcan3Q9JKK0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rcan3Q9JKK0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Rcan3Q9JKK0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Rcan3Q9JKK0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Rcan3Q9JKK0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rcan3Q9JKK0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rcan3Q9JKK0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Rcan3Q9JKK0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Rcan3Q9JKK0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Rcan3Q9JKK0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rcan3Q9JKK0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rcan3Q9JKK0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rcan3Q9JKK0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rcan3Q9JKK0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rcan3Q9JKK0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rcan3Q9JKK0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rcan3Q9JKK0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Rcan3Q9JKK0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rcan3Q9JKK0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rcan3Q9JKK0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Rcan3Q9JKK0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Rcan3Q9JKK0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Rcan3Q9JKK0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Rcan3Q9JKK0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rcan3Q9JKK0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Rcan3Q9JKK0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rcan3Q9JKK0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Rcan3Q9JKK0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rcan3Q9JKK0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Rcan3Q9JKK0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rcan3Q9JKK0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Rcan3Q9JKK0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Rcan3Q9JKK0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Rcan3Q9JKK0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rcan3Q9JKK0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Rcan3Q9JKK0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Rcan3Q9JKK0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Rcan3Q9JKK0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Rcan3Q9JKK0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Rcan3Q9JKK0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rcan3Q9JKK0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Rcan3Q9JKK0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rcan3Q9JKK0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Rcan3Q9JKK0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Rcan3Q9JKK0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rcan3Q9JKK0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Rcan3Q9JKK0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Rcan3Q9JKK0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Rcan3Q9JKK0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms