Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Msgn1Q9JK54 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Msgn1Q9JK54 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Msgn1Q9JK54 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Msgn1Q9JK54 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Msgn1Q9JK54 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Msgn1Q9JK54 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Msgn1Q9JK54 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Msgn1Q9JK54 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Msgn1Q9JK54 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Msgn1Q9JK54 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Msgn1Q9JK54 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Msgn1Q9JK54 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Msgn1Q9JK54 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Msgn1Q9JK54 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Msgn1Q9JK54 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Msgn1Q9JK54 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Msgn1Q9JK54 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Msgn1Q9JK54 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Msgn1Q9JK54 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Msgn1Q9JK54 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Msgn1Q9JK54 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Msgn1Q9JK54 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Msgn1Q9JK54 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Msgn1Q9JK54 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Msgn1Q9JK54 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Msgn1Q9JK54 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Msgn1Q9JK54 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Msgn1Q9JK54 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Msgn1Q9JK54 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Msgn1Q9JK54 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Msgn1Q9JK54 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Msgn1Q9JK54 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Msgn1Q9JK54 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Msgn1Q9JK54 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Msgn1Q9JK54 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Msgn1Q9JK54 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Msgn1Q9JK54 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Msgn1Q9JK54 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Msgn1Q9JK54 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Msgn1Q9JK54 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Msgn1Q9JK54 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Msgn1Q9JK54 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Msgn1Q9JK54 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
Msgn1Q9JK54 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Msgn1Q9JK54 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Msgn1Q9JK54 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Msgn1Q9JK54 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Msgn1Q9JK54 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Msgn1Q9JK54 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Msgn1Q9JK54 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Msgn1Q9JK54 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Msgn1Q9JK54 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Msgn1Q9JK54 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Msgn1Q9JK54 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Msgn1Q9JK54 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Msgn1Q9JK54 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Msgn1Q9JK54 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Msgn1Q9JK54 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Msgn1Q9JK54 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Msgn1Q9JK54 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Msgn1Q9JK54 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Msgn1Q9JK54 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Msgn1Q9JK54 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Msgn1Q9JK54 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Msgn1Q9JK54 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Msgn1Q9JK54 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Msgn1Q9JK54 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Msgn1Q9JK54 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Msgn1Q9JK54 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Msgn1Q9JK54 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Msgn1Q9JK54 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Msgn1Q9JK54 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Msgn1Q9JK54 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Msgn1Q9JK54 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Msgn1Q9JK54 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Msgn1Q9JK54 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Msgn1Q9JK54 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Msgn1Q9JK54 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Msgn1Q9JK54 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Msgn1Q9JK54 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Msgn1Q9JK54 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Msgn1Q9JK54 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Msgn1Q9JK54 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Msgn1Q9JK54 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Msgn1Q9JK54 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Msgn1Q9JK54 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Msgn1Q9JK54 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Msgn1Q9JK54 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Msgn1Q9JK54 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Msgn1Q9JK54 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Msgn1Q9JK54 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Msgn1Q9JK54 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Msgn1Q9JK54 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Msgn1Q9JK54 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Msgn1Q9JK54 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Msgn1Q9JK54 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Msgn1Q9JK54 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Msgn1Q9JK54 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Msgn1Q9JK54 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms