Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Tulp4Q9JIL5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Tulp4Q9JIL5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
Tulp4Q9JIL5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Tulp4Q9JIL5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Tulp4Q9JIL5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Tulp4Q9JIL5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
Tulp4Q9JIL5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
Tulp4Q9JIL5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Tulp4Q9JIL5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Tulp4Q9JIL5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Tulp4Q9JIL5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Tulp4Q9JIL5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Tulp4Q9JIL5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
Tulp4Q9JIL5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Tulp4Q9JIL5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
Tulp4Q9JIL5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
Tulp4Q9JIL5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
Tulp4Q9JIL5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
Tulp4Q9JIL5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Tulp4Q9JIL5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
Tulp4Q9JIL5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
Tulp4Q9JIL5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Tulp4Q9JIL5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Tulp4Q9JIL5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Tulp4Q9JIL5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
Tulp4Q9JIL5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Tulp4Q9JIL5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
Tulp4Q9JIL5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
Tulp4Q9JIL5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
Tulp4Q9JIL5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
Tulp4Q9JIL5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Tulp4Q9JIL5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Tulp4Q9JIL5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
Tulp4Q9JIL5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC39.07■■■■□ 3.84
Tulp4Q9JIL5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Tulp4Q9JIL5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Tulp4Q9JIL5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
Tulp4Q9JIL5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
Tulp4Q9JIL5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Tulp4Q9JIL5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
Tulp4Q9JIL5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
Tulp4Q9JIL5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Tulp4Q9JIL5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
Tulp4Q9JIL5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
Tulp4Q9JIL5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
Tulp4Q9JIL5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC38.82■■■■□ 3.8
Tulp4Q9JIL5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Tulp4Q9JIL5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
Tulp4Q9JIL5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC38.75■■■■□ 3.79
Tulp4Q9JIL5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Tulp4Q9JIL5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Tulp4Q9JIL5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Tulp4Q9JIL5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Tulp4Q9JIL5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Tulp4Q9JIL5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Tulp4Q9JIL5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Tulp4Q9JIL5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.74
Tulp4Q9JIL5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.74
Tulp4Q9JIL5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Tulp4Q9JIL5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Tulp4Q9JIL5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Tulp4Q9JIL5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Tulp4Q9JIL5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Tulp4Q9JIL5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Tulp4Q9JIL5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Tulp4Q9JIL5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Tulp4Q9JIL5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Tulp4Q9JIL5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Tulp4Q9JIL5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Tulp4Q9JIL5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Tulp4Q9JIL5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Tulp4Q9JIL5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Tulp4Q9JIL5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Tulp4Q9JIL5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Tulp4Q9JIL5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Tulp4Q9JIL5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Tulp4Q9JIL5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Tulp4Q9JIL5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Tulp4Q9JIL5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Tulp4Q9JIL5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Tulp4Q9JIL5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
Tulp4Q9JIL5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Tulp4Q9JIL5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Tulp4Q9JIL5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Tulp4Q9JIL5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Tulp4Q9JIL5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Tulp4Q9JIL5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.66
Tulp4Q9JIL5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Tulp4Q9JIL5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Tulp4Q9JIL5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Tulp4Q9JIL5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Tulp4Q9JIL5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Tulp4Q9JIL5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Tulp4Q9JIL5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Tulp4Q9JIL5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Tulp4Q9JIL5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Tulp4Q9JIL5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Tulp4Q9JIL5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Tulp4Q9JIL5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms