Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI33

Ntn4, Netrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn4Q9JI33 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ntn4Q9JI33 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ntn4Q9JI33 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ntn4Q9JI33 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ntn4Q9JI33 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ntn4Q9JI33 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ntn4Q9JI33 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ntn4Q9JI33 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ntn4Q9JI33 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ntn4Q9JI33 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ntn4Q9JI33 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ntn4Q9JI33 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ntn4Q9JI33 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ntn4Q9JI33 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ntn4Q9JI33 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ntn4Q9JI33 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ntn4Q9JI33 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ntn4Q9JI33 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ntn4Q9JI33 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ntn4Q9JI33 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ntn4Q9JI33 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ntn4Q9JI33 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ntn4Q9JI33 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ntn4Q9JI33 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ntn4Q9JI33 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ntn4Q9JI33 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ntn4Q9JI33 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ntn4Q9JI33 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ntn4Q9JI33 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ntn4Q9JI33 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ntn4Q9JI33 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ntn4Q9JI33 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ntn4Q9JI33 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ntn4Q9JI33 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ntn4Q9JI33 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ntn4Q9JI33 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ntn4Q9JI33 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ntn4Q9JI33 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ntn4Q9JI33 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ntn4Q9JI33 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ntn4Q9JI33 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ntn4Q9JI33 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ntn4Q9JI33 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ntn4Q9JI33 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ntn4Q9JI33 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ntn4Q9JI33 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ntn4Q9JI33 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ntn4Q9JI33 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ntn4Q9JI33 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ntn4Q9JI33 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ntn4Q9JI33 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ntn4Q9JI33 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ntn4Q9JI33 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ntn4Q9JI33 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ntn4Q9JI33 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ntn4Q9JI33 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ntn4Q9JI33 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ntn4Q9JI33 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ntn4Q9JI33 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ntn4Q9JI33 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ntn4Q9JI33 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ntn4Q9JI33 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ntn4Q9JI33 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ntn4Q9JI33 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ntn4Q9JI33 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ntn4Q9JI33 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ntn4Q9JI33 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ntn4Q9JI33 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ntn4Q9JI33 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ntn4Q9JI33 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ntn4Q9JI33 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ntn4Q9JI33 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ntn4Q9JI33 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ntn4Q9JI33 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ntn4Q9JI33 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ntn4Q9JI33 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ntn4Q9JI33 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ntn4Q9JI33 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ntn4Q9JI33 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ntn4Q9JI33 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ntn4Q9JI33 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ntn4Q9JI33 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ntn4Q9JI33 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ntn4Q9JI33 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ntn4Q9JI33 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ntn4Q9JI33 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ntn4Q9JI33 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ntn4Q9JI33 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ntn4Q9JI33 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ntn4Q9JI33 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ntn4Q9JI33 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ntn4Q9JI33 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ntn4Q9JI33 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ntn4Q9JI33 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ntn4Q9JI33 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ntn4Q9JI33 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ntn4Q9JI33 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ntn4Q9JI33 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ntn4Q9JI33 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ntn4Q9JI33 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms