Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pgpep1Q9ESW8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Pgpep1Q9ESW8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Pgpep1Q9ESW8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pgpep1Q9ESW8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pgpep1Q9ESW8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pgpep1Q9ESW8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pgpep1Q9ESW8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pgpep1Q9ESW8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pgpep1Q9ESW8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pgpep1Q9ESW8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pgpep1Q9ESW8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pgpep1Q9ESW8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pgpep1Q9ESW8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pgpep1Q9ESW8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pgpep1Q9ESW8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pgpep1Q9ESW8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pgpep1Q9ESW8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pgpep1Q9ESW8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pgpep1Q9ESW8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pgpep1Q9ESW8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pgpep1Q9ESW8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pgpep1Q9ESW8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pgpep1Q9ESW8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pgpep1Q9ESW8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pgpep1Q9ESW8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pgpep1Q9ESW8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pgpep1Q9ESW8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pgpep1Q9ESW8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pgpep1Q9ESW8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pgpep1Q9ESW8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pgpep1Q9ESW8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pgpep1Q9ESW8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pgpep1Q9ESW8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pgpep1Q9ESW8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pgpep1Q9ESW8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pgpep1Q9ESW8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pgpep1Q9ESW8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pgpep1Q9ESW8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pgpep1Q9ESW8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pgpep1Q9ESW8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pgpep1Q9ESW8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pgpep1Q9ESW8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pgpep1Q9ESW8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pgpep1Q9ESW8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pgpep1Q9ESW8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pgpep1Q9ESW8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pgpep1Q9ESW8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pgpep1Q9ESW8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pgpep1Q9ESW8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pgpep1Q9ESW8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pgpep1Q9ESW8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pgpep1Q9ESW8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pgpep1Q9ESW8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pgpep1Q9ESW8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pgpep1Q9ESW8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pgpep1Q9ESW8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pgpep1Q9ESW8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pgpep1Q9ESW8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pgpep1Q9ESW8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pgpep1Q9ESW8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pgpep1Q9ESW8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pgpep1Q9ESW8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pgpep1Q9ESW8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pgpep1Q9ESW8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pgpep1Q9ESW8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pgpep1Q9ESW8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pgpep1Q9ESW8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pgpep1Q9ESW8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pgpep1Q9ESW8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pgpep1Q9ESW8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pgpep1Q9ESW8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pgpep1Q9ESW8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pgpep1Q9ESW8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pgpep1Q9ESW8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pgpep1Q9ESW8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pgpep1Q9ESW8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pgpep1Q9ESW8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pgpep1Q9ESW8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pgpep1Q9ESW8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pgpep1Q9ESW8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pgpep1Q9ESW8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pgpep1Q9ESW8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pgpep1Q9ESW8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pgpep1Q9ESW8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pgpep1Q9ESW8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pgpep1Q9ESW8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pgpep1Q9ESW8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pgpep1Q9ESW8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pgpep1Q9ESW8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pgpep1Q9ESW8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pgpep1Q9ESW8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pgpep1Q9ESW8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pgpep1Q9ESW8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pgpep1Q9ESW8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pgpep1Q9ESW8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pgpep1Q9ESW8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pgpep1Q9ESW8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pgpep1Q9ESW8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pgpep1Q9ESW8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms