Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim39Q9ESN2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim39Q9ESN2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim39Q9ESN2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim39Q9ESN2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim39Q9ESN2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim39Q9ESN2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim39Q9ESN2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim39Q9ESN2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim39Q9ESN2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim39Q9ESN2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim39Q9ESN2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim39Q9ESN2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim39Q9ESN2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim39Q9ESN2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim39Q9ESN2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim39Q9ESN2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim39Q9ESN2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trim39Q9ESN2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trim39Q9ESN2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trim39Q9ESN2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trim39Q9ESN2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim39Q9ESN2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trim39Q9ESN2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trim39Q9ESN2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim39Q9ESN2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim39Q9ESN2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim39Q9ESN2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim39Q9ESN2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim39Q9ESN2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim39Q9ESN2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim39Q9ESN2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim39Q9ESN2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim39Q9ESN2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim39Q9ESN2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim39Q9ESN2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim39Q9ESN2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim39Q9ESN2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim39Q9ESN2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim39Q9ESN2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim39Q9ESN2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim39Q9ESN2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim39Q9ESN2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim39Q9ESN2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim39Q9ESN2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim39Q9ESN2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim39Q9ESN2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim39Q9ESN2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trim39Q9ESN2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim39Q9ESN2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim39Q9ESN2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim39Q9ESN2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim39Q9ESN2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim39Q9ESN2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim39Q9ESN2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim39Q9ESN2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim39Q9ESN2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim39Q9ESN2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim39Q9ESN2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim39Q9ESN2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim39Q9ESN2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim39Q9ESN2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim39Q9ESN2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim39Q9ESN2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim39Q9ESN2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim39Q9ESN2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim39Q9ESN2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim39Q9ESN2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim39Q9ESN2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim39Q9ESN2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim39Q9ESN2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim39Q9ESN2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim39Q9ESN2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim39Q9ESN2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim39Q9ESN2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim39Q9ESN2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim39Q9ESN2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim39Q9ESN2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim39Q9ESN2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim39Q9ESN2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim39Q9ESN2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim39Q9ESN2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim39Q9ESN2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim39Q9ESN2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim39Q9ESN2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim39Q9ESN2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim39Q9ESN2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Trim39Q9ESN2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim39Q9ESN2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Trim39Q9ESN2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim39Q9ESN2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Trim39Q9ESN2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Trim39Q9ESN2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim39Q9ESN2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trim39Q9ESN2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim39Q9ESN2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim39Q9ESN2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trim39Q9ESN2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim39Q9ESN2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Trim39Q9ESN2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms