Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Erg28Q9ERY9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Erg28Q9ERY9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Erg28Q9ERY9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Erg28Q9ERY9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Erg28Q9ERY9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Erg28Q9ERY9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Erg28Q9ERY9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Erg28Q9ERY9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Erg28Q9ERY9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Erg28Q9ERY9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Erg28Q9ERY9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Erg28Q9ERY9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Erg28Q9ERY9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Erg28Q9ERY9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Erg28Q9ERY9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Erg28Q9ERY9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Erg28Q9ERY9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Erg28Q9ERY9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Erg28Q9ERY9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Erg28Q9ERY9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Erg28Q9ERY9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Erg28Q9ERY9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Erg28Q9ERY9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Erg28Q9ERY9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Erg28Q9ERY9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Erg28Q9ERY9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Erg28Q9ERY9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Erg28Q9ERY9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Erg28Q9ERY9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Erg28Q9ERY9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Erg28Q9ERY9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Erg28Q9ERY9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Erg28Q9ERY9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Erg28Q9ERY9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Erg28Q9ERY9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Erg28Q9ERY9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Erg28Q9ERY9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Erg28Q9ERY9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Erg28Q9ERY9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Erg28Q9ERY9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Erg28Q9ERY9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Erg28Q9ERY9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Erg28Q9ERY9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Erg28Q9ERY9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Erg28Q9ERY9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Erg28Q9ERY9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Erg28Q9ERY9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Erg28Q9ERY9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Erg28Q9ERY9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Erg28Q9ERY9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Erg28Q9ERY9 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Erg28Q9ERY9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Erg28Q9ERY9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Erg28Q9ERY9 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Erg28Q9ERY9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Erg28Q9ERY9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Erg28Q9ERY9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Erg28Q9ERY9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Erg28Q9ERY9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Erg28Q9ERY9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Erg28Q9ERY9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Erg28Q9ERY9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Erg28Q9ERY9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Erg28Q9ERY9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Erg28Q9ERY9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Erg28Q9ERY9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Erg28Q9ERY9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Erg28Q9ERY9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Erg28Q9ERY9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Erg28Q9ERY9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Erg28Q9ERY9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Erg28Q9ERY9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Erg28Q9ERY9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Erg28Q9ERY9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Erg28Q9ERY9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Erg28Q9ERY9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Erg28Q9ERY9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Erg28Q9ERY9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Erg28Q9ERY9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Erg28Q9ERY9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Erg28Q9ERY9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erg28Q9ERY9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erg28Q9ERY9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Erg28Q9ERY9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erg28Q9ERY9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erg28Q9ERY9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erg28Q9ERY9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Erg28Q9ERY9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erg28Q9ERY9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erg28Q9ERY9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erg28Q9ERY9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Erg28Q9ERY9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Erg28Q9ERY9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Erg28Q9ERY9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Erg28Q9ERY9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Erg28Q9ERY9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Erg28Q9ERY9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Erg28Q9ERY9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Erg28Q9ERY9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms