Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slco1c1Q9ERB5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slco1c1Q9ERB5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Slco1c1Q9ERB5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Slco1c1Q9ERB5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Slco1c1Q9ERB5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Slco1c1Q9ERB5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slco1c1Q9ERB5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slco1c1Q9ERB5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slco1c1Q9ERB5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slco1c1Q9ERB5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slco1c1Q9ERB5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Slco1c1Q9ERB5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slco1c1Q9ERB5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slco1c1Q9ERB5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slco1c1Q9ERB5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slco1c1Q9ERB5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Slco1c1Q9ERB5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Slco1c1Q9ERB5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Slco1c1Q9ERB5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Slco1c1Q9ERB5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slco1c1Q9ERB5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Slco1c1Q9ERB5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Slco1c1Q9ERB5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slco1c1Q9ERB5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Slco1c1Q9ERB5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Slco1c1Q9ERB5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Slco1c1Q9ERB5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Slco1c1Q9ERB5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slco1c1Q9ERB5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slco1c1Q9ERB5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slco1c1Q9ERB5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slco1c1Q9ERB5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slco1c1Q9ERB5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slco1c1Q9ERB5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slco1c1Q9ERB5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slco1c1Q9ERB5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Slco1c1Q9ERB5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slco1c1Q9ERB5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Slco1c1Q9ERB5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Slco1c1Q9ERB5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Slco1c1Q9ERB5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Slco1c1Q9ERB5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Slco1c1Q9ERB5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Slco1c1Q9ERB5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Slco1c1Q9ERB5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Slco1c1Q9ERB5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Slco1c1Q9ERB5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Slco1c1Q9ERB5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Slco1c1Q9ERB5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slco1c1Q9ERB5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Slco1c1Q9ERB5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Slco1c1Q9ERB5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Slco1c1Q9ERB5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slco1c1Q9ERB5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slco1c1Q9ERB5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Slco1c1Q9ERB5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slco1c1Q9ERB5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Slco1c1Q9ERB5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slco1c1Q9ERB5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slco1c1Q9ERB5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slco1c1Q9ERB5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slco1c1Q9ERB5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slco1c1Q9ERB5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slco1c1Q9ERB5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slco1c1Q9ERB5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slco1c1Q9ERB5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Slco1c1Q9ERB5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slco1c1Q9ERB5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slco1c1Q9ERB5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Slco1c1Q9ERB5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slco1c1Q9ERB5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slco1c1Q9ERB5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slco1c1Q9ERB5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slco1c1Q9ERB5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Slco1c1Q9ERB5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Slco1c1Q9ERB5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slco1c1Q9ERB5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slco1c1Q9ERB5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Slco1c1Q9ERB5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Slco1c1Q9ERB5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Slco1c1Q9ERB5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slco1c1Q9ERB5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Slco1c1Q9ERB5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Slco1c1Q9ERB5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slco1c1Q9ERB5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Slco1c1Q9ERB5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Slco1c1Q9ERB5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Slco1c1Q9ERB5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Slco1c1Q9ERB5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Slco1c1Q9ERB5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slco1c1Q9ERB5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slco1c1Q9ERB5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Slco1c1Q9ERB5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slco1c1Q9ERB5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slco1c1Q9ERB5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Slco1c1Q9ERB5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Slco1c1Q9ERB5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Slco1c1Q9ERB5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms